RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-206	ENST00000563597	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	NBN	O60934	754 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	IFNAR1	P17181	557 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	RABGGTB	P53611	331 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	NTRK3	Q16288	839 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	PKN1	Q16512	942 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	PHKB	Q93100	1093 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	SETD4	Q9NVD3	440 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM260	Q9NX78	707 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	TREH	O43280	583 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	CAND2	O75155	1236 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	THPO	P40225	353 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	KCNJ6	P48051	423 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	NRCAM	Q92823	1304 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4C-206	ENST00000563597	GNA11	P29992	359 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ARHGAP4	P98171	946 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	SDF4	Q9BRK5	362 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	NFASC	O94856	1347 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	MEIS1	O00470	390 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	RSPH10B	P0C881	870 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAM17	P78536	824 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	MBTPS1	Q14703	1052 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	GLG1	Q92896	1179 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	EFCAB14	O75071	495 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	AR	P10275	920 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ZNF76	P36508	570 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	BICD2	Q8TD16	824 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	MYO9B	Q13459	2157 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	KIF28P	B7ZC32	967 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	MYOG	P15173	224 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	IKBKE	Q14164	716 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	KAT6A	Q92794	2004 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	LGR5	O75473	907 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CYP3A4	P08684	503 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	PPFIA1	Q13136	1202 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	AZI2	Q9H6S1	392 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	CA3	P07451	260 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	MARK3	P27448	753 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ACTR2	P61160	394 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM86B1	E9PN63	330 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	CPLX1	O14810	134 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	PPFIA3	O75145	1194 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	GRIK4	Q16099	956 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	TCTN1	Q2MV58	587 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	RPAIN	Q86UA6	219 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	PCYT2	Q99447	389 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAMTS3	O15072	1205 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	TLL1	O43897	1013 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	CTSH	P09668	335 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	ANAPC15	P60006	121 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	DEFB103A	P81534	67 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-206	ENST00000563597	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11

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