RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 SP8Q8IXZ3 490 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC89Q8N998 374 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 BSNDQ8WZ55 320 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FAM89AQ96GI7 184 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 EYSQ5T1H1 3165 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB39O15060 712 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PRMT3O60678 531 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 COQ9O75208 318 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MTA2O94776 668 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TGFB3P10600 412 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 KCNA2P16389 499 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CES1P23141 567 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CD96P40200 585 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GSTM4Q03013 218 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 C1QL4Q86Z23 238 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA1Q92805 767 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MISP3Q96FF7 219 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TTC14Q96N46 770 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM17Q9Y577 477 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 BRD3Q15059 726 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MLANAQ16655 118 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PARP10Q53GL7 1025 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 COPS6Q7L5N1 327 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DYMQ7RTS9 669 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CHPFQ8IZ52 775 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DPF2Q92785 391 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 GMLQ99445 158 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-209ENST00000561136 H0YGN5 161 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NXPE3Q969Y0 559 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SHISA4Q96DD7 197 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 BORCS6Q96GS4 357 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FRMD6Q96NE9 622 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms