RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHCBP1Q8NEM2 672 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPRASP2Q96D09 838 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYDC2Q96IM9 177 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RWDD2AQ9UIY3 292 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNM3Q9UQ16 869 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 LCTP09848 1927 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAFGO15525 162 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX15O43143 795 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBASH3AP57075 661 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNNM4Q6P4Q7 775 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRX1Q86UT6 975 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSD17B14Q9BPX1 270 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH8Q9H579 483 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTN2Q02246 1040 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 STIM1Q13586 685 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPH2Q8IWU9 490 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC19Q96DA6 116 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TUFT1Q9NNX1 390 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC39A2Q9NP94 309 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASTN1O14525 1302 aa19.87■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEB2H3BUK9 544 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLITRK3O94933 977 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTGS1P23219 599 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC12A3P55017 1021 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPHA7Q15375 998 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM133AQ8N9E0 248 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN18Q99952 460 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM49BA6NDI0 452 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP11B2P19099 503 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUTP22033 750 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA0895Q8NCT3 520 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMA7O14818 248 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBFA2T2O43439 604 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS20O76081 388 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARSHQ5FYA8 562 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PANK4Q9NVE7 773 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MORF4L1Q9UBU8 362 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.85■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP9AO75110 1047 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDNRBP24530 442 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PMS1P54277 932 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCNA1P78396 465 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 COASYQ13057 564 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 STXBP2Q15833 593 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIER3Q7Z3K6 550 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEK9Q8TD19 979 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDHR1Q96JP9 859 aa19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 EYA4O95677 639 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCTD2Q14681 263 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNPTABQ3T906 1256 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDKAL1Q5VV42 579 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGMBQ6NW40 437 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMC6Q7Z403 805 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP19Q99542 508 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 BHMT2Q9H2M3 363 aa19.83■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF3CO14782 793 aa19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB39O15060 712 aa19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPM3P06753 285 aa19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN21Q16825 1174 aa19.83■□□□□ 0.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms