RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF174	Q15697	407 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SCLY	Q96I15	445 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PCYT2	Q99447	389 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573		B4DLN1	442 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	LGALS2	P05162	132 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP2C18	P33260	490 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	CPT1A	P50416	773 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM29	Q14134	588 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SETD4	Q9NVD3	440 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SCN5A	Q14524	2016 aa		11.47	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB39	O15060	712 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ACR	P10323	421 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ACTR2	P61160	394 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	UGCG	Q16739	394 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	DGKD	Q16760	1214 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	BAD	Q92934	168 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.46	□□□□□ -0.57
FAM227B-208	ENST00000559573	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.46	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	EML1	O00423	815 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	ICAM3	P32942	547 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	EPHB4	P54760	987 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	HAS1	Q92839	578 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	GLG1	Q92896	1179 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BRB1	525 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	ARVCF	O00192	962 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	XBP1	P17861	261 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CDC25A	P30304	524 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	MFSD10	Q14728	455 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.45	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	EVPL	Q92817	2033 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TREH	O43280	583 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	PSEN2	P49810	448 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CDK7	P50613	346 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BQV1	296 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	BACH1	O14867	736 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP3A4	P08684	503 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TGFB3	P10600	412 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP4A	P20648	1035 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	TXK	P42681	527 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	NEDD9	Q14511	834 aa		11.44	□□□□□ -0.58
FAM227B-208	ENST00000559573	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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