RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 GHRP10912 638 aa20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 METTL7BQ6UX53 244 aa20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 RSPH3Q86UC2 560 aa20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 RILPL2Q969X0 211 aa20.65■□□□□ 0.9
TSPAN3-204ENST00000558394 KLRF2D3W0D1 207 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LINC01565O15544 149 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ADAM15Q13444 863 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 IER5LQ5T953 404 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIOO75962 3097 aa20.64■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 NRCAMQ92823 1304 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LAMA4Q16363 1823 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 STAM2O75886 525 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 HOMER1Q86YM7 354 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.63■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 EYA4O95677 639 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CHRNA1P02708 482 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM50Q86XT4 487 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 FBXL6Q8N531 539 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 GPR20Q99678 358 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 KRT23Q9C075 422 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.62■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ENPP3O14638 875 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LINC00271P0C7V0 271 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ZXDAP98168 799 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SP4Q02446 784 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 P2RX5Q93086 422 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TTC3P53804 2025 aa20.61■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 FIBPO43427 364 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 GFRA3O60609 400 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 DGKIO75912 1065 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ICAM3P32942 547 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 EFHBQ8N7U6 833 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 MTMR8Q96EF0 704 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ADAM17P78536 824 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 COASYQ13057 564 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LPIN1Q14693 890 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SDSP20132 328 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 NRIP1P48552 1158 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TCF15Q12870 199 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 PPFIA1Q13136 1202 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 CLEC1BQ9P126 229 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-204ENST00000558394 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 ITGB1P05556 798 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 STAG3L1P0CL83 205 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 CAMK1Q14012 370 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 POF1BQ8WVV4 589 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 PIGSQ96S52 555 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSPAN3-204ENST00000558394 MGAT3Q09327 533 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms