RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF3Q5VWG9 929 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TLR10Q9BXR5 811 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 F5H6K3 240 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ICA1Q05084 483 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRC3Q07444 240 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM71BQ8TC56 605 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MKL1Q969V6 931 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MS4A14Q96JA4 679 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PJA2O43164 708 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP4A11Q02928 519 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN26Q16670 478 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF4Q8WV16 495 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP63Q96MT8 703 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACTN1P12814 892 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP3A7P24462 503 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP9Q49MG5 647 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBC1D5Q92609 795 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 LENG9Q96B70 501 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 NYAP2Q9P242 653 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCN9AQ15858 1988 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF40O75150 1001 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 NR2F2P24468 414 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSL1Q68DK7 614 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBOAT7Q96N66 472 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSPH10BP0C881 870 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN2P17655 700 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCM3P25205 808 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNH2Q12809 1159 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 GIT2Q14161 759 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 REEP2Q9BRK0 252 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 NDUFB10O96000 172 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERPING1P05155 500 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMP10P09238 476 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH1B1P30837 517 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXD13P35453 343 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 SFR1Q86XK3 245 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087X0T9 212 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM228BP0C875 321 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 GGCXP38435 758 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQCEQ6IPM2 695 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOX5Q96PH1 765 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMNQ9BXJ7 453 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 FTCDO95954 541 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYBP10242 640 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRLRP16471 622 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLRC1P26715 233 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARSP56192 900 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC181Q5TID7 509 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACBD3Q9H3P7 528 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED4Q9NPJ6 270 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 OPLAHO14841 1288 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 PALMO75781 387 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC9A1P19634 815 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPS15P42566 896 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms