RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 NID2Q14112 1375 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 RSPH10B2B2RC85 870 aa27.92■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 RSPH10BP0C881 870 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 PHKBQ93100 1093 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.92■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 KAT6AQ92794 2004 aa27.91■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 MARK3P27448 753 aa27.91■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.91■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.91■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 C6orf50Q9HD87 102 aa27.91■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 CTSHP09668 335 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 IGFBP4P22692 258 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 HOXC8P31273 242 aa27.9■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 CEP55Q53EZ4 464 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 NRCAMQ92823 1304 aa27.9■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa27.89■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.89■■■□□ 2.06
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PRKCH-216ENST00000555542 AZI2Q9H6S1 392 aa27.89■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.89■■■□□ 2.06
PRKCH-216ENST00000555542 DLL1O00548 723 aa27.88■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 TLL1O43897 1013 aa27.88■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 EFCAB14O75071 495 aa27.88■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 ARP10275 920 aa27.88■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 MBTPS1Q14703 1052 aa27.88■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 MCTP2Q6DN12 878 aa27.87■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.87■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 DEFB103AP81534 67 aa27.86■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 TCTN1Q2MV58 587 aa27.85■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.85■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 DBF4BQ8NFT6 615 aa27.85■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 BICD2Q8TD16 824 aa27.85■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 ACTR2P61160 394 aa27.84■■■□□ 2.05
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PRKCH-216ENST00000555542 RSPH3Q86UC2 560 aa27.83■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.83■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.83■■■□□ 2.05
PRKCH-216ENST00000555542 AMHP03971 560 aa27.82■■■□□ 2.04
PRKCH-216ENST00000555542 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PRKCH-216ENST00000555542 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PRKCH-216ENST00000555542 STK3Q13188 491 aa27.82■■■□□ 2.04
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