RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 GPC2Q8N158 579 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.63□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 POLR2MP0CAP2 368 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 SV2BQ7L1I2 683 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 NELFBQ8WX92 580 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 RAD54LQ92698 747 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 GJA10Q969M2 543 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 EXOC1Q9NV70 894 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 INTS13Q9NVM9 706 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.62□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 FAM86B1E9PN63 330 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 MTMR2Q13614 643 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 MCM6Q14566 821 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ECM1Q16610 540 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 RINLQ6ZS11 566 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 MARVELD3Q96A59 401 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 FAM20AQ96MK3 541 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 WDR18Q9BV38 432 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 MYMKA6NI61 221 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ZNF76P36508 570 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 PPP1R2P41236 205 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 EPS15P42566 896 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CCZ1BP86790 482 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SPAG1Q07617 926 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 PDE4DQ08499 809 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 NR1I3Q14994 352 aa8.6□□□□□ -1.03
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