RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542776.5

POP5-208, Transcript of POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 2

Gene POP5, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP5-208	ENST00000542776	CA3	P07451	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	HOXC8	P31273	242 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RBL2	Q08999	1139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PTK7	Q13308	1070 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MTMR1	Q13613	665 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	NEDD9	Q14511	834 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	KRT40	Q6A162	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	NID2	Q14112	1375 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	STAM2	O75886	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SCG2	P13521	617 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	THPO	P40225	353 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	STK3	Q13188	491 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	NTRK3	Q16288	839 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	EDIL3	O43854	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CXCL10	P02778	98 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PFKM	P08237	780 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RFC2	P35250	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	IGBP1	P78318	339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ADAM17	P78536	824 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RAB30	Q15771	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	GJA10	Q969M2	543 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CCNE2	O96020	404 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ACTN1	P12814	892 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	IGFBP4	P22692	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SREBF1	P36956	1147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	EVC	P57679	992 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	DLL1	O00548	723 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	LGR5	O75473	907 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SEC24B	O95487	1268 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	ACTR2	P61160	394 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP5-208	ENST00000542776	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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