RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530301.5

RDX-210, Transcript of radixin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDX, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDX-210ENST00000530301 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.1■■■□□ 2.25
RDX-210ENST00000530301 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.1■■■□□ 2.25
RDX-210ENST00000530301 FANCLQ9NW38 375 aa29.1■■■□□ 2.25
RDX-210ENST00000530301 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.252e-7■■■□□ 15.9
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RDX-210ENST00000530301 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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RDX-210ENST00000530301 HSD3B7Q9H2F3 369 aa29.08■■■□□ 2.25
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RDX-210ENST00000530301 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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RDX-210ENST00000530301 CYP4A11Q02928 519 aa29.06■■■□□ 2.24
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RDX-210ENST00000530301 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.06■■■□□ 2.24
RDX-210ENST00000530301 GDAQ9Y2T3 454 aa29.06■■■□□ 2.24
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RDX-210ENST00000530301 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.05■■■□□ 2.24
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RDX-210ENST00000530301 IMPACTQ9P2X3 320 aa29.04■■■□□ 2.24
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RDX-210ENST00000530301 P2RX5Q93086 422 aa29.02■■■□□ 2.24
RDX-210ENST00000530301 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa29.02■■■□□ 2.24
RDX-210ENST00000530301 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 STRNO43815 780 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 PSMC5P62195 406 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 GIT2Q14161 759 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 Q3C1V9 767 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.01■■■□□ 2.23
RDX-210ENST00000530301 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.01■■■□□ 2.23
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