RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	CYTH3	O43739	400 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	PLA2G6	O60733	806 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	PSMC6	P62333	389 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	TRAF1	Q13077	416 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	SCLY	Q96I15	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131		Q9Y3F1	56 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MEG3-223	ENST00000524131	STXBP3	O00186	592 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ALAS1	P13196	640 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	BMP1	P13497	986 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PLA2G5	P39877	138 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TFF2	Q03403	129 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	NR5A1	Q13285	461 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131		M0R2N6	131 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	NR1I2	O75469	434 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SLC1A4	P43007	532 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	LAD1	O00515	517 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ZEB2	O60315	1214 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PFKM	P08237	780 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	KCNQ1	P51787	676 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	NAPA	P54920	295 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SNAP25	P60880	206 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CA3	P07451	260 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2C9	P11712	490 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
MEG3-223	ENST00000524131	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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