RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	MAP3K10	Q02779	954 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	TPH2	Q8IWU9	490 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	DYDC2	Q96IM9	177 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		18.98	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	ABCB11	O95342	1321 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PQJ5	194 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	PLA2G6	O60733	806 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	AR	P10275	920 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	FIGN	Q5HY92	759 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	PSMD10	O75832	226 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	PTGER2	P43116	358 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CBX1	P83916	185 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	SFI1	A8K8P3	1242 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	MYB	P10242	640 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF536	O15090	1300 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CTAGE9	A4FU28	777 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	SLITRK3	O94933	977 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	POLD1	P28340	1107 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	TNIP1	Q15025	636 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CEP55	Q53EZ4	464 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	CPXCR1	Q8N123	301 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	SLC5A5	Q92911	643 aa		18.96	■□□□□ 0.63
MEG3-222	ENST00000524035	RCCD1	A6NED2	376 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	GAS7	O60861	476 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	HOXD13	P35453	343 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ADAM9	Q13443	819 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	TEX35	Q5T0J7	233 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	HOOK2	Q96ED9	719 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	COL20A1	Q9P218	1284 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	BCS1L	Q9Y276	419 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	NFIB	O00712	420 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	EYA4	O95677	639 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	KIAA1328	Q86T90	577 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	RASSF7	Q02833	373 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	RRAGA	Q7L523	313 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	STK24	Q9Y6E0	443 aa		18.95	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	LRRC53	A6NM62	1247 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	APBA1	Q02410	837 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ICAM1	P05362	532 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PPP2R5C	Q13362	524 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		18.94	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF263	O14978	683 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	KIF20A	O95235	890 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	NR2F2	P24468	414 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	PRELP	P51888	382 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	KRT83	P78385	493 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	IL31RA	Q8NI17	732 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CDC23	Q9UJX2	597 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	ALAS1	P13196	640 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	CLCN6	P51797	869 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	KCNA1	Q09470	495 aa		18.93	■□□□□ 0.62
MEG3-222	ENST00000524035	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms