RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 PLIN2Q99541 437 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 STK17AQ9UEE5 414 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-210ENST00000519815 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.71□□□□□ -0.53
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TRPS1-210ENST00000519815 EDNRBP24530 442 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 AFMP43652 599 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NOGQ13253 232 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.7□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.7□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 ASTN1O14525 1302 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 RGS20O76081 388 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 APLP1P51693 650 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SV2BQ7L1I2 683 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 MED24O75448 989 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 ZNF792Q3KQV3 632 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 ZIC5Q96T25 663 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-210ENST00000519815 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 NFASCO94856 1347 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 POTEB3A0JP26 581 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 BIN1O00499 593 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 ATP9AO75110 1047 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 TGFB3P10600 412 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SFNP31947 248 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-210ENST00000519815 MRE11P49959 708 aa11.67□□□□□ -0.54
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