RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SLITRK3O94933 977 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 POSTNQ15063 836 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 GNPTABQ3T906 1256 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 CEP57L1Q8IYX8 460 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 CALML4Q96GE6 196 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 RIT2Q99578 217 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa17.4■□□□□ 0.38
TRPS1-206ENST00000517323 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ADCYAP1R1P41586 468 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MAP2K5Q13163 448 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RNF214Q8ND24 703 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LXNQ9BS40 222 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GGPS1O95749 300 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ALDH1A1P00352 501 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PRKCZQ05513 592 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TAPT1Q6NXT6 567 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DYMQ7RTS9 669 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TIGD1Q96MW7 591 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TINF2Q9BSI4 451 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 KATNBL1Q9H079 304 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF236Q9UL36 1845 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM32Q13049 653 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 USP6NLQ92738 828 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HPS3Q969F9 1004 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D22BQ9NU19 505 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TXNP10599 105 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 BMP6P22004 513 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RPA1P27694 616 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MAP2K2P36507 400 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ACTR2P61160 394 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SP3Q02447 781 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TYRO3Q06418 890 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LRSAM1Q6UWE0 723 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MORC4Q8TE76 937 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RAD54LQ92698 747 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MYMKA6NI61 221 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ASB14A6NK59 587 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FLT3LGP49771 235 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF445P59923 1031 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM50Q86XT4 487 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DNAJC25Q9H1X3 360 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 STAM2O75886 525 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ICAM3P32942 547 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DPYDQ12882 1025 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ERMNQ8TAM6 284 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.36■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ELNP15502 786 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MAF1Q9H063 256 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RBSNQ9H1K0 784 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PLA2G4BP0C869 781 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FCGRTP55899 365 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GSE1Q14687 1217 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 EPHA7Q15375 998 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ANO6Q4KMQ2 910 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HYIQ5T013 277 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TRIB2Q92519 343 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.35■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 WDR64B1ANS9 1081 aa17.34■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF862O60290 1169 aa17.34■□□□□ 0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SMPD1P17405 629 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms