RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ASB2Q96Q27 587 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RAD9AQ99638 391 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 JADE2Q9NQC1 790 aa28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.26■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 NRCAMQ92823 1304 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 AMHP03971 560 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 SPRED2Q7Z698 418 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.25■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 TRANK1O15050 2925 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MAFGO15525 162 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 ADAM17P78536 824 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 FUT2Q10981 343 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT8Q92599 483 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 SIP14410 1827 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 KAT6AQ92794 2004 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 ADCY7P51828 1080 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 RCAN1P53805 252 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 GRB10Q13322 594 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 IL27Q8NEV9 243 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MARK3P27448 753 aa28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 FGD1P98174 961 aa28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 KRT40Q6A162 431 aa28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 LINC01553A4QN01 128 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 STXBP3O00186 592 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 PPFIA1Q13136 1202 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 GLG1Q92896 1179 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 PGBD1Q96JS3 809 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 ANO3Q9BYT9 981 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 BARHL2Q9NY43 387 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 INSL6Q9Y581 213 aa28.21■■■□□ 2.11
ALYREF-203ENST00000511412 LPXNO60711 386 aa28.2■■■□□ 2.1
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ALYREF-203ENST00000511412 FAM26DQ5JW98 314 aa28.2■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.2■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 APBB2Q92870 758 aa28.2■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.2■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 REV3LO60673 3130 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CDC27P30260 824 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 ERVK-21P61565 698 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 AP3B2Q13367 1082 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 GRIK4Q16099 956 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.19■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SMCO2A6NFE2 343 aa28.18■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TNFRSF10AO00220 468 aa28.18■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 AAK1Q2M2I8 961 aa28.18■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.18■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 RPAINQ86UA6 219 aa28.18■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.18■■■□□ 2.1
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ALYREF-203ENST00000511412 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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ALYREF-203ENST00000511412 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 RSPH3Q86UC2 560 aa28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 KCNB2Q92953 911 aa28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 AZI2Q9H6S1 392 aa28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TTC28Q96AY4 2481 aa28.17■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 COL4A6Q14031 1691 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CPA1P15085 419 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 HSPA4P34932 840 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SREBF1P36956 1147 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TFF2Q03403 129 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CEP55Q53EZ4 464 aa28.16■■■□□ 2.1
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