RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506438.5

PITX1-205, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-205ENST00000506438 ALG1Q9BT22 464 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 C6orf50Q9HD87 102 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 MUC3AQ02505 3323 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 ZNF286BP0CG31 522 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 ANAPC15P60006 121 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 MTMR1Q13613 665 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 BICD2Q8TD16 824 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 JADE2Q9NQC1 790 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 COG5Q9UP83 839 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-205ENST00000506438 ESYT2A0FGR8 921 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 H3BRB1 525 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 HAS3O00219 553 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CPLX1O14810 134 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 IFNAR1P17181 557 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 GRB10Q13322 594 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SORBS3O60504 671 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 GNAT1P11488 350 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ZNF76P36508 570 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 GPR20Q99678 358 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ANO3Q9BYT9 981 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 LCHNA4D1U4 455 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 LGALS2P05162 132 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CKBP12277 381 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ITGB5P18084 799 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 DEFB103AP81534 67 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SEMA3FQ13275 785 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 PTK7Q13308 1070 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ANKRD1Q15327 319 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 HLA-CQ95604 372 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SREBF1P36956 1147 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 RBL2Q08999 1139 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CEP55Q53EZ4 464 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SPRED2Q7Z698 418 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SDF4Q9BRK5 362 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 NBNO60934 754 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CDKL5O76039 1030 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CXCL10P02778 98 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 KCNA2P16389 499 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 GPNMBQ14956 572 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 NTRK3Q16288 839 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 PHKBQ93100 1093 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-205ENST00000506438 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 EFCAB14O75071 495 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 SP4Q02446 784 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 DEXIO95424 95 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 IKBKEQ14164 716 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 PKN1Q16512 942 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 TET1Q8NFU7 2136 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 RAD9AQ99638 391 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 LPXNO60711 386 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 ATP9AO75110 1047 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 GJB5O95377 273 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX1-205ENST00000506438 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms