RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 DDAH1O94760 285 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CKMP06732 381 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 GLRBP48167 497 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 DPTQ07507 201 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NRN1LQ496H8 165 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CSRNP2Q9H175 543 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 PCSK5Q92824 1860 aa4.01□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 DLX3O60479 287 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 GJB6O95452 261 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 IL18BPO95998 194 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CPP00450 1065 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NAT2P11245 290 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 INHBCP55103 352 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 PPP2R2AP63151 447 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 PTH1RQ03431 593 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 STPG3Q8N7X2 389 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 DTX3Q8N9I9 347 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ADOQ96SZ5 270 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 A0A1W2PQU0 124 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 BLACEA4D250 179 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 KNG1P01042 644 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CSF2RBP32927 897 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TUSC3Q13454 348 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SKIDA1Q1XH10 827 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 Q6ZUG5 572 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZNF503Q96F45 646 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 LRRC37BQ96QE4 947 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 KCNJ15Q99712 375 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 IER2Q9BTL4 223 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SLC6A20Q9NP91 592 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 A0A087X1B8 175 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ACOT7O00154 380 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 DGCR2P98153 550 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NTRK3Q16288 839 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 USP53Q70EK8 1073 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CCDC140Q96MF4 163 aa3.99□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ST7Q9NRC1 585 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 E9PSI1 815 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 FAHP16930 419 aa3.98□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 PFKPQ01813 784 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CD276Q5ZPR3 534 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 VASNQ6EMK4 673 aa3.98□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 DLL4Q9NR61 685 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 PRKAG3Q9UGI9 489 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 EDAQ92838 391 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 EXTL1Q92935 676 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 AJUBAQ96IF1 538 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 CD244Q9BZW8 370 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 GPR27Q9NS67 375 aa3.97□□□□□ -1.77
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RBM39-242ENST00000498280 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM39-242ENST00000498280 ASXL2Q76L83 1435 aa3.96□□□□□ -1.77
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