RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAK1Q13153 545 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CR1LQ2VPA4 569 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC27A2O14975 620 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMY2BP19961 511 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX3-2P78367 333 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRED1Q7Z699 444 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK32CQ86UX6 486 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROSER1Q86XN7 944 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAPGEF3O95398 923 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6P13671 934 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACVRL1P37023 503 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM9Q13443 819 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR19Q15760 415 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSTM1Q86WC4 334 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KYQ8NBH2 561 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD244Q9BZW8 370 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.84□□□□□ -1.31
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