RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 SETD4Q9NVD3 440 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 MAFGO15525 162 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 BAIAP3O94812 1187 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 SREBF1P36956 1147 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 THPOP40225 353 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 EVCP57679 992 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 NTRK3Q16288 839 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 TCTN1Q2MV58 587 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 SLC9A7Q96T83 725 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 ARP10275 920 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 CEP55Q53EZ4 464 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-207ENST00000492954 ESYT2A0FGR8 921 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GNAT1P11488 350 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 MARK3P27448 753 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGAP4P98171 946 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GBF1Q92538 1859 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 MEIS1O00470 390 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 RSPH10BP0C881 870 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 IFNAR1P17181 557 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 KCNJ6P48051 423 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ADAM17P78536 824 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GLG1Q92896 1179 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 SDF4Q9BRK5 362 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 C6orf50Q9HD87 102 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 NFASCO94856 1347 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 NRCAMQ92823 1304 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CA3P07451 260 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CTSHP09668 335 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF76P36508 570 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 DEFB103AP81534 67 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PCYT2Q99447 389 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 EMSYQ7Z589 1322 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 FAM86B1E9PN63 330 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 LGR5O75473 907 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ACTR2P61160 394 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PPFIA1Q13136 1202 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRE1Q14246 886 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CAND2O75155 1236 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGEF15O94989 841 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CYP3A4P08684 503 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GNA11P29992 359 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 GRIK4Q16099 956 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 USP38Q8NB14 1042 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 MYO9BQ13459 2157 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 KIF28PB7ZC32 967 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 STK3Q13188 491 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 IKBKEQ14164 716 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 MCTP2Q6DN12 878 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-207ENST00000492954 UIMC1Q96RL1 719 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms