RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GLI4P10075 376 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PNLIPP16233 465 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA5P54756 1037 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PLCL1Q15111 1095 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TERF2Q15554 542 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 NLRX1Q86UT6 975 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF3Q86WH2 238 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 DLG3Q92796 817 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM22Q9NS69 142 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 GPR160Q9UJ42 338 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SHTN1A0MZ66 631 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-21P61565 698 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 MYLIPQ8WY64 445 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CD244Q9BZW8 370 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 MYOTQ9UBF9 498 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 DVL2O14641 736 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SLC27A2O14975 620 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SRGAP3O43295 1099 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 WNT11O96014 354 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 RAB27AP51159 221 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 KIR3DS1Q14943 382 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CPZQ66K79 652 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PEX11GQ96HA9 241 aa10.24□□□□□ -0.77
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PTPRC-212ENST00000491302 SP110Q9HB58 689 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP10O43572 662 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN6O43657 245 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CFBP00751 764 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CD40P25942 277 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC32Q14392 662 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 RELTQ969Z4 430 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 HOOK2Q96ED9 719 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf48Q96LL4 319 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 VTA1Q9NP79 307 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TNKSO95271 1327 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CYBBP04839 570 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CCND1P24385 295 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 FNTBP49356 437 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TUSC3Q13454 348 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN21Q16825 1174 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 INAVAQ3KP66 663 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 NME9Q86XW9 330 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SGSM2O43147 1006 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB7AO95365 584 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 DBHP09172 617 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 MYBL2P10244 700 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SDHAP31040 664 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ERVFC1P60507 584 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD7Q6ZUT3 714 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CHPFQ8IZ52 775 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CDH19Q9H159 772 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PALD1Q9ULE6 856 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB7P26010 798 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY1Q08828 1119 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 NR1I3Q14994 352 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 SHISA4Q96DD7 197 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 KRT85P78386 507 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A5Q14940 896 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA7Q15375 998 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRC-212ENST00000491302 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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