RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CLK2P49760 499 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
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HOXB3-211ENST00000490677 Q6ZUG5 572 aa31.87■■■□□ 2.69
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HOXB3-211ENST00000490677 CYP2W1Q8TAV3 490 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXB3-211ENST00000490677 LMBR1Q8WVP7 490 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXB3-211ENST00000490677 PGBD1Q96JS3 809 aa31.87■■■□□ 2.69
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HOXB3-211ENST00000490677 RSPH10BP0C881 870 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXB3-211ENST00000490677 MXRA8Q9BRK3 442 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXB3-211ENST00000490677 EMSYQ7Z589 1322 aa31.84■■■□□ 2.69
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HOXB3-211ENST00000490677 KCNH7Q9NS40 1196 aa31.84■■■□□ 2.69
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HOXB3-211ENST00000490677 PKN1Q16512 942 aa31.81■■■□□ 2.68
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HOXB3-211ENST00000490677 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
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HOXB3-211ENST00000490677 ZMYND12Q9H0C1 365 aa31.77■■■□□ 2.68
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HOXB3-211ENST00000490677 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-211ENST00000490677 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-211ENST00000490677 PPFIA1Q13136 1202 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-211ENST00000490677 ARNTL2Q8WYA1 636 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-211ENST00000490677 RAD9AQ99638 391 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-211ENST00000490677 FAM86B1E9PN63 330 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-211ENST00000490677 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
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