RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 ODF2Q5BJF6 829 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 GJA10Q969M2 543 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 UIMC1Q96RL1 719 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 C6orf50Q9HD87 102 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 STK17AQ9UEE5 414 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ACTN1P12814 892 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CDR1P51861 262 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ASIC2Q16515 512 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CEP57Q86XR8 500 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MTMR9Q96QG7 549 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 BTG4Q9NY30 223 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MCM8Q9UJA3 840 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 GGA2Q9UJY4 613 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PHLPP1O60346 1717 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MAFGO15525 162 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DAPK3O43293 454 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 KIF4AO95239 1232 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ITGA4P13612 1032 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 COASYQ13057 564 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SOGA3Q5TF21 947 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CHADLQ6NUI6 762 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 FAM228AQ86W67 206 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 RAPGEF5Q92565 580 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PIGSQ96S52 555 aa11.23□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SART1O43290 800 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 GNA11P29992 359 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PTK2Q05397 1052 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CUL1Q13616 776 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 FUKQ8N0W3 1084 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SCFD2Q8WU76 684 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SCLT1Q96NL6 688 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 OPLAHO14841 1288 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 EDIL3O43854 480 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PPP2R2AP63151 447 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 NEDD9Q14511 834 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 MDM1Q8TC05 714 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 AMACRQ9UHK6 382 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SUFUQ9UMX1 484 aa11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 FAM170AA1A519 330 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 USP11P51784 963 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DRP2Q13474 957 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ITPK1Q13572 414 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SNCBQ16143 134 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PROM2Q8N271 834 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 METTL13Q8N6R0 699 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 LRRC45Q96CN5 670 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 GANQ9H2C0 597 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 DPH5Q9H2P9 285 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 PANK4Q9NVE7 773 aa11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
VWA3B-217ENST00000489630 KRIT1O00522 736 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms