RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 RUFY3Q7L099 469 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 SDF4Q9BRK5 362 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.14■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CXCL10P02778 98 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CA3P07451 260 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ARP10275 920 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 AP3B2Q13367 1082 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 IKBKEQ14164 716 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TET1Q8NFU7 2136 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CERS4Q9HA82 394 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 C6orf50Q9HD87 102 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TLL1O43897 1013 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 MBTPS1Q14703 1052 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TCTN1Q2MV58 587 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CEP55Q53EZ4 464 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 MYO9BQ13459 2157 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 LGR5O75473 907 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 SREBF1P36956 1147 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PPFIA1Q13136 1202 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PKN1Q16512 942 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 FBXL16Q8N461 479 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 UIMC1Q96RL1 719 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 HOXC8P31273 242 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 IGBP1P78318 339 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 DEFB103AP81534 67 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ADGRE1Q14246 886 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 AZI2Q9H6S1 392 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 EMSYQ7Z589 1322 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 NRCAMQ92823 1304 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 COL6A3P12111 3177 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 GBF1Q92538 1859 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ADAMTS3O15072 1205 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 GNA11P29992 359 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 STK3Q13188 491 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 GRIK4Q16099 956 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 USP38Q8NB14 1042 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ESYT2A0FGR8 921 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 RFXAPO00287 272 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 MEIS1O00470 390 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 CPLX1O14810 134 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 EFCAB14O75071 495 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ACTR2P61160 394 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 NTRK3Q16288 839 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 TRPC6Q9Y210 931 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD2-208ENST00000489356 NFASCO94856 1347 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 IFNAR1P17181 557 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 ADAM17P78536 824 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 NID2Q14112 1375 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 SEPT8Q92599 483 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 PCYT2Q99447 389 aa20.08■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 FAM86B1E9PN63 330 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 CAND2O75155 1236 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 EVCP57679 992 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 NLRP5P59047 1200 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD2-208ENST00000489356 TAP1Q03518 808 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms