RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 ERVK-21P61565 698 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GPM6BQ13491 265 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NEDD9Q14511 834 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 WTAPQ15007 396 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PGM5Q15124 567 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PROX2Q3B8N5 592 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CASC1Q6TDU7 716 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SPRED2Q7Z698 418 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NLRX1Q86UT6 975 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GJD3Q8N144 294 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 FIBCD1Q8N539 461 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 KAT2BQ92831 832 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 APBB2Q92870 758 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GLG1Q92896 1179 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 USP26Q9BXU7 913 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CLDND1Q9NY35 253 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 COL20A1Q9P218 1284 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.23□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 FIBPO43427 364 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CAND2O75155 1236 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 STAM2O75886 525 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TGFB3P10600 412 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MARK3P27448 753 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 KIF5BP33176 963 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 HSD17B4P51659 736 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 IGBP1P78318 339 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RBL2Q08999 1139 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 AAMPQ13685 434 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 EPC2Q52LR7 807 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SERINC5Q86VE9 423 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM192Q8IY95 271 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 BANK1Q8NDB2 785 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 IL17RAQ96F46 866 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PIGSQ96S52 555 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 IGFLR1Q9H665 355 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 AZI2Q9H6S1 392 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 SETD4Q9NVD3 440 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 MUC3AQ02505 3323 aa6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 NCOR1O75376 2440 aa6.21□□□□□ -1.41
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC69A6NI79 296 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 TREHO43280 583 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 NCK2O43639 380 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 LPXNO60711 386 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 GHRP10912 638 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 IL9P15248 144 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 NDUFV1P49821 464 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 PPFIA1Q13136 1202 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 CLUL1Q15846 466 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 METTL7BQ6UX53 244 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 TRIM50Q86XT4 487 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 NCOA7Q8NI08 942 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 IL31RAQ8NI17 732 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 VWCEQ96DN2 955 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 CDHR1Q96JP9 859 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.21□□□□□ -1.42
AC004889.1-208ENST00000489077 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms