RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EHD4	Q9H223	541 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	BTAF1	O14981	1849 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PDXK	O00764	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EDIL3	O43854	480 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PALM	O75781	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	FLOT1	O75955	427 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADAM9	Q13443	819 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GRIK5	Q16478	980 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TLR2	O60603	784 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRAF1	Q13077	416 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYB	P10242	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GNGT1	P63211	74 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LY75	O60449	1722 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRIM66	O15016	1216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP11B2	P19099	503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP8	P40818	1118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRRC41	Q15345	812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NFIL3	Q16649	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MKL1	Q969V6	931 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	BUB1	O43683	1085 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GAP43	P17677	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KLRC1	P26715	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305		Q4G0T1	1027 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	RPA1	P27694	616 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CXCR5	P32302	372 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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