RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 JCADQ9P266 1359 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 THAP12O43422 761 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC63Q05C16 580 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.52□□□□□ -0.08
HDLBP-241ENST00000487169 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB33Q86T24 672 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 NLRP7Q8WX94 980 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 P3H4Q92791 437 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 MYOM1P52179 1685 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GMNNO75496 209 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 CHRNA5P30532 468 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GUCY2DQ02846 1103 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 MGARPQ8TDB4 240 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 POLD4Q9HCU8 107 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.52□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 H7C0C1 242 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ATP5OP48047 213 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 MTMR1Q13613 665 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 FBXO40Q9UH90 709 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 STK36Q9NRP7 1315 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 RNF146Q9NTX7 359 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 MAPK4P31152 587 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 STX2P32856 288 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 RCAN1P53805 252 aa14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.51□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 I3L4J1 428 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 AKR1B1P15121 316 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 STMN2Q93045 179 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 A6NJR5 290 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF233A6NK53 670 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 CUL4BQ13620 913 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 KRT31Q15323 416 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 STXBP2Q15833 593 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.5□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF131P52739 623 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 VPS72Q15906 364 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 C12orf60Q5U649 245 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 RESP18Q5W5W9 173 aa14.49□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 SNX25Q9H3E2 840 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.49□□□□□ -0.09
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HDLBP-241ENST00000487169 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.49□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 PASKQ96RG2 1323 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 E9PMD0 336 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 ORC4O43929 436 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 OATP04181 439 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 CXCR5P32302 372 aa14.48□□□□□ -0.09
HDLBP-241ENST00000487169 GRM4Q14833 912 aa14.48□□□□□ -0.09
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