RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 CAGE1Q8TC20 777 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 AZI2Q9H6S1 392 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 IL23AQ9NPF7 189 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PITPNM1O00562 1244 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ACRP10323 421 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PTK7Q13308 1070 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM29Q14134 588 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SCLYQ96I15 445 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 M0R2N6 131 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ST18O60284 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ACTR2P61160 394 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IL27Q8NEV9 243 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 UIMC1Q96RL1 719 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 8.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 JAK2O60674 1132 aa21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 NPY5RQ15761 445 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM240Q5SV17 173 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF365Q70YC5 407 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 MARK3P27448 753 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 RFC2P35250 354 aa21.86■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.86■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 EMSYQ7Z589 1322 aa21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 BACH1O14867 736 aa21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 INF2Q27J81 1249 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 SELPP16109 830 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT76Q01546 638 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ST3GAL1Q11201 340 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 HIC1Q14526 733 aa21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.092e-7■■□□□ 12.9
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SH3BP4-209ENST00000484097 ACTN1P12814 892 aa21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 NEK8Q86SG6 692 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SERINC5Q86VE9 423 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OXER1Q8TDS5 423 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 LENG9Q96B70 501 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.83■■□□□ 1.09
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