RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 CHRNA1P02708 482 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 NEFLP07196 543 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 SP2Q02086 613 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 MTMR3Q13615 1198 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 DUSP6Q16828 381 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB33Q86T24 672 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 NEK1Q96PY6 1258 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 TLE6Q9H808 572 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 H3BRB1 525 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FOXP2O15409 715 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RAB11FIP3O75154 756 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 APPP05067 770 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 NR3C2P08235 984 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SNHG28P0DPA3 235 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 PDHBP11177 359 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 NPR3P17342 541 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 MGAT3Q09327 533 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 LPIN1Q14693 890 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ANGPT1Q15389 498 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SPATA33Q96N06 139 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RMDN3Q96TC7 470 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 CDH22Q9UJ99 828 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.46□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FSCN2O14926 492 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SORBS3O60504 671 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GGPS1O95749 300 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 LGALS2P05162 132 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FGRP09769 529 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GHRP10912 638 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 AOC1P19801 751 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ERVFC1P60507 584 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF543Q08ER8 600 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 USH1GQ495M9 461 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 BCL11AQ9H165 835 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 PXMP2Q9NR77 195 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 SETD4Q9NVD3 440 aa8.45□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FSD2A1L4K1 749 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ORC4O43929 436 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ASGR2P07307 311 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TECP42680 631 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 UBE3AQ05086 875 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 APOL5Q9BWW9 433 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 NAPBQ9H115 298 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 POMKQ9H5K3 350 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 NR2E1Q9Y466 385 aa8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 KAT6AQ92794 2004 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 OPLAHO14841 1288 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 PPFIA3O75145 1194 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 TGFB3P10600 412 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GNAT1P11488 350 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GATMP50440 423 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 GHRHRQ02643 423 aa8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CASQ1-203ENST00000481081 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms