RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 SAMM50Q9Y512 469 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 SLITRK3O94933 977 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 MAPK4P31152 587 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 ARMCX2Q7L311 632 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 GPRASP2Q96D09 838 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 RBSNQ9H1K0 784 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 STRNO43815 780 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 TYRO3Q06418 890 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 COPS5Q92905 334 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 RIT2Q99578 217 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-217ENST00000475693 CYP2B6P20813 491 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CCL14Q16627 93 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM150BA6NC51 233 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CTAGE5O15320 804 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 BMP6P22004 513 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 UGCGQ16739 394 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 GNPTABQ3T906 1256 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MORN1Q5T089 497 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MAML3Q96JK9 1138 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TSPY26PQ9H489 355 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 RPA1P27694 616 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 DPYDQ12882 1025 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 DYMQ7RTS9 669 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 RAD54LQ92698 747 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MAF1Q9H063 256 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 PSMC4P43686 418 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM47Q96LD4 638 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 RNF186Q9NXI6 227 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 GJD2Q9UKL4 321 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MYMKA6NI61 221 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ERMNQ8TAM6 284 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 LXNQ9BS40 222 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TSKSQ9UJT2 592 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 GABRQQ9UN88 632 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC192P0DO97 292 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HYIQ5T013 277 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HPS3Q969F9 1004 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 STAM2O75886 525 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ICAM3P32942 547 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CYP2C19P33261 490 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MAP2K5Q13163 448 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 EPHA7Q15375 998 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ASB14A6NK59 587 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MAFGO15525 162 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 GGPS1O95749 300 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 PLA2G4BP0C869 781 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 KANK3Q6NY19 840 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 MORC4Q8TE76 937 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 SMARCE1Q969G3 411 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ACTR2P61160 394 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms