RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474882.2

MYCBP2-205, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-205	ENST00000474882	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SLC27A2	O14975	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MAFK	O60675	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TADA3	O75528	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	HPX	P02790	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SSTR4	P31391	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	LSP1	P33241	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	GDNF	P39905	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SLC6A11	P48066	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KIF11	P52732	1056 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	EPHA5	P54756	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ERVFC1	P60507	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PHC1	P78364	1004 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CYP4F8	P98187	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SEC23A	Q15436	765 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CABP7	Q86V35	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	FZD9	O00144	591 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SGSM2	O43147	1006 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MT-CO1	P00395	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	LTF	P02788	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MYBL2	P10244	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PNLIP	P16233	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TUSC3	Q13454	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	CDH19	Q9H159	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	ABLIM3	O94929	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	CYP17A1	P05093	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	DBH	P09172	617 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	GJA4	P35212	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	GALK1	P51570	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	SNX17	Q15036	470 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MYCBP2-205	ENST00000474882	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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