RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88A-210ENST00000468534 WRNIP1Q96S55 665 aa6.42□□□□□ -1.38
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CCDC88A-210ENST00000468534 COL6A2P12110 1019 aa6.41□□□□□ -1.38
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CCDC88A-210ENST00000468534 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCDC88A-210ENST00000468534 CD248Q9HCU0 757 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 SRRDQ9UH36 339 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 FAHP16930 419 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 SLFN13Q68D06 897 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCDC88A-210ENST00000468534 NSMFQ6X4W1 530 aa6.35□□□□□ -1.39
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