RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 RPS6KB1P23443 525 aa6.67□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 ITGA7Q13683 1181 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 GPATCH11Q8N954 259 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 ERMNQ8TAM6 284 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.67□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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SHQ1-205ENST00000468371 UBE2SQ16763 222 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 USP28Q96RU2 1077 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 DEF6Q9H4E7 631 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 DENND3A2RUS2 1198 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 PLA2G6O60733 806 aa6.65□□□□□ -1.35
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