RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465245.1

TRA2B-208, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 3

Gene TRA2B, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-208	ENST00000465245	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245		M0R296	226 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	GHR	P10912	638 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	NEDD9	Q14511	834 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	GPR20	Q99678	358 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CHRNA1	P02708	482 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ADAM17	P78536	824 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ADAM15	Q13444	863 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	IER5L	Q5T953	404 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PRRX2	Q99811	253 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	KRT23	Q9C075	422 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	FIBP	O43427	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ST18	O60284	1047 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	STAM2	O75886	525 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SDS	P20132	328 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ICAM3	P32942	547 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SP4	Q02446	784 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TRAF1	Q13077	416 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	LPIN1	Q14693	890 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PKN1	Q16512	942 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	DMD	P11532	3685 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ENPP3	O14638	875 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	EYA4	O95677	639 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MGAT3	Q09327	533 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CAMK1	Q14012	370 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	P2RX5	Q93086	422 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PIGS	Q96S52	555 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	DGKI	O75912	1065 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ITGB1	P05556	798 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	DNAJB1	P25685	340 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ZXDA	P98168	799 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TCF15	Q12870	199 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TRA2B-208	ENST00000465245	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	NRIP1	P48552	1158 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	COASY	Q13057	564 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRA2B-208	ENST00000465245	SEC23A	Q15436	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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