RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 DISC1Q9NRI5 854 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 MCM3APO60318 1980 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 PSAPP07602 524 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 SPECC1Q5M775 1068 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 TRPV1Q8NER1 839 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 SPC25Q9HBM1 224 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 TUFT1Q9NNX1 390 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 SORBS3O60504 671 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V0A1Q93050 837 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 EPSTI1Q96J88 318 aa10.54□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 DGKDQ16760 1214 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 DYDC2Q96IM9 177 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-208ENST00000462602 HPSEQ9Y251 543 aa10.53□□□□□ -0.72
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SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.52□□□□□ -0.73
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