RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF536O15090 1300 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 B4GALT3O60512 393 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SOD2P04179 222 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 VASNQ6EMK4 673 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB11FIP3O75154 756 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 LTFP02788 710 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM17P78536 824 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATC1Q76KD6 591 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 MBD6Q96DN6 1003 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 LOXL4Q96JB6 756 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SAMD11Q96NU1 681 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 DLL4Q9NR61 685 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ASXL2Q76L83 1435 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 FAHP16930 419 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 DTX3Q8N9I9 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ALG1Q9BT22 464 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PDPK1O15530 556 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 LAMTOR5O43504 91 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF19Q5T6S3 580 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 IPPKQ9H8X2 491 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 DSEQ9UL01 958 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 COL6A1P12109 1028 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 INSRRP14616 1297 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 RASGRF1Q13972 1273 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 MTERF2Q49AM1 385 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ADCY3O60266 1144 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 GPATCH3Q96I76 525 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 C8orf49Q96NF6 230 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC6Q99741 560 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TLDC2A0PJX2 215 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CKMP06732 381 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP2B1P20020 1258 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NFATC3Q12968 1075 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CD276Q5ZPR3 534 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 KCTD1Q719H9 257 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CHST13Q8NET6 341 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT11Q96G61 164 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 AQP7O14520 342 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 EPHA5P54756 1037 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF4Q96M43 638 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CD244Q9BZW8 370 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO21O94952 628 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 CHGBP05060 677 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 GLRBP48167 497 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 CPZQ66K79 652 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 NACADO15069 1562 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL18O94889 574 aa6.45□□□□□ -1.38
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