RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSEN2P49810 448 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFSD5Q6N075 450 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC5A5Q92911 643 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMX3Q96JJ7 454 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCYT2Q99447 389 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIT2Q99578 217 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EMSYQ7Z589 1322 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SZT2Q5T011 3432 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOP56O00567 594 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCNE2O96020 404 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF76P36508 570 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFSD10Q14728 455 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT40Q6A162 431 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABHD15Q6UXT9 468 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OXER1Q8TDS5 423 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VWCEQ96DN2 955 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HDAC6Q9UBN7 1215 aa12.75□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSH4O15457 936 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DTNBO60941 627 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAG1P15918 1043 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACTR2P61160 394 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CUL4AQ13619 759 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIC1Q14526 733 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AFAP1L1Q8TED9 768 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BADQ92934 168 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SDF4Q9BRK5 362 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.74□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTBD18B2RXH4 712 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBX3O15119 743 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMD10O75832 226 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF286BP0CG31 522 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT2P35908 639 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC26A2P50443 739 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTK7Q13308 1070 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR16Q569H4 304 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASIP1Q5U651 963 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C16orf59Q7L2K0 433 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEK8Q86SG6 692 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPAINQ86UA6 219 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SERINC5Q86VE9 423 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf31Q8N865 590 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAGE1Q8TC20 777 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM20AQ96MK3 541 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNPEPQ9H4A4 650 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.73□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRCAMQ92823 1304 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SORBS3O60504 671 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPHB4P54760 987 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT76Q01546 638 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NR5A1Q13285 461 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTGISQ16647 500 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INF2Q27J81 1249 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TDHQ8IZJ6 230 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RDM1Q8NG50 284 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WNT8AQ9H1J5 351 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIPK3Q9H422 1215 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.71□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TDP2O95551 362 aa12.71□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa12.71□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa12.71□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNAT1P11488 350 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms