RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 HPS3Q969F9 1004 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 GPRASP2Q96D09 838 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 HTTP42858 3142 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 COPB2P35606 906 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 MORC3Q14149 939 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 SV2BQ7L1I2 683 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 ERMNQ8TAM6 284 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM9Q9C026 710 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 KLRC4O43908 158 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 STK17AQ9UEE5 414 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 SMC2O95347 1197 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 PLA2G4BP0C869 781 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 UGCGQ16739 394 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR81Q562E7 1941 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM150BA6NC51 233 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TLR2O60603 784 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ARIH2O95376 493 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 IQCB1Q15051 598 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 LY6KQ17RY6 165 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 LXNQ9BS40 222 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GDAQ9Y2T3 454 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ASIC1P78348 528 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 C17orf99Q6UX52 265 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX12PQ92771 950 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CUEDC2Q9H467 287 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 AP5Z1O43299 807 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 EPHA7Q15375 998 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GNPTABQ3T906 1256 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 MAF1Q9H063 256 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TM4SF4P48230 202 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ARSHQ5FYA8 562 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DPP9Q86TI2 863 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPNS2Q96L46 248 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GSDMAQ96QA5 445 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CTGFP29279 349 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC12A3P55017 1021 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 INHBEP58166 350 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 PLCB2Q00722 1185 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 SREBF2Q12772 1141 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DNM3Q9UQ16 869 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ARMCX2Q7L311 632 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GPBP1Q86WP2 473 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 COPS5Q92905 334 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 MED15Q96RN5 788 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 MAFGO15525 162 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 IDEP14735 1019 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GRB14Q14449 540 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 STAM2O75886 525 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP11B2P19099 503 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 STRNO43815 780 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-204ENST00000452765 MAPK4P31152 587 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ICAM3P32942 547 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 APLP1P51693 650 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 STX17P56962 302 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTR2P61160 394 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms