RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.65■□□□□ 0.9
PTX4-202ENST00000440447 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.65■□□□□ 0.9
PTX4-202ENST00000440447 WNT7AO00755 349 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 STX6O43752 255 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 EVI5O60447 810 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PSMD10O75832 226 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ATG7O95352 703 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 CCNE2O96020 404 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PSEN2P49810 448 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MFSD10Q14728 455 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ZNF174Q15697 407 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 CALCRLQ16602 461 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TRIM60Q495X7 471 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 BRAPQ7Z569 592 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 AZI2Q9H6S1 392 aa20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 GRIN2DO15399 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 H3BRB1 525 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 CDK7P50613 346 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 HAS1Q92839 578 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 GLG1Q92896 1179 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 WDR64B1ANS9 1081 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 HAS3O00219 553 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 CHMP2AO43633 222 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TLE2Q04725 743 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 FERMT3Q86UX7 667 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TRIM50Q86XT4 487 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MTMR6Q9Y217 621 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SAMM50Q9Y512 469 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.62■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 EMSYQ7Z589 1322 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 BACH1O14867 736 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 LGR5O75473 907 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PSAPP07602 524 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SFNP31947 248 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 JAK3P52333 1124 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 C7orf31Q8N865 590 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TOX2Q96NM4 488 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 DISC1Q9NRI5 854 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 STAT5BP51692 787 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 NBR1Q14596 966 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 RDM1Q8NG50 284 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MTMR9Q96QG7 549 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PCYT2Q99447 389 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ZNF302Q9NR11 478 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TXKP42681 527 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 RESTQ13127 1097 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PPP2R5CQ13362 524 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SESTD1Q86VW0 696 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 VAV3Q9UKW4 847 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 OR52Z1P0C646 297 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MARK3P27448 753 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 SLC26A2P50443 739 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-202ENST00000440447 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms