RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MTMR8Q96EF0 704 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 NCOR1O75376 2440 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HAS3O00219 553 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CDKL5O76039 1030 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CXCL10P02778 98 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 THPOP40225 353 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GNAQP50148 359 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RBL2Q08999 1139 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MBTPS1Q14703 1052 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.25□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CYTH3O43739 400 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LPXNO60711 386 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GJB5O95377 273 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GHRHRQ02643 423 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 IKBKEQ14164 716 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.138e-7■□□□□ 9.2
PRAME-208ENST00000438888 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HLA-CQ95604 372 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PTPRSQ13332 1948 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LINC01553A4QN01 128 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 JAK2O60674 1132 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PPFIA4O75335 1185 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LGR5O75473 907 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CTDNEP1O95476 244 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CTSHP09668 335 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 IFNAR1P17181 557 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SP4Q02446 784 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 NTRK3Q16288 839 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RAD9AQ99638 391 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 COG5Q9UP83 839 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 EFCAB14O75071 495 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 LGALS2P05162 132 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RSPH10BP0C881 870 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRIM50Q86XT4 487 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 EMSYQ7Z589 1322 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 STK36Q9NRP7 1315 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 H3BRB1 525 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TREHO43280 583 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 AMHP03971 560 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TGFB3P10600 412 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SMARCA1P28370 1054 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GJB2P29033 226 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 FUT2Q10981 343 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TRAF1Q13077 416 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GNPTABQ3T906 1256 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SERINC5Q86VE9 423 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PHKBQ93100 1093 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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