RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435020.1

RPS28P8-201, Transcript of ribosomal protein S28 pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene RPS28P8, Length 208 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPS28P8-201ENST00000435020 CCNE2O96020 404 aa9.71□□□□□ -0.86
RPS28P8-201ENST00000435020 CALM1P0DP23 149 aa9.71□□□□□ -0.86
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