RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.89■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.89■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 RAD9AQ99638 391 aa23.89■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 CERS4Q9HA82 394 aa23.89■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 JADE2Q9NQC1 790 aa23.89■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 NRCAMQ92823 1304 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 RFXAPO00287 272 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 SP4Q02446 784 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 KCNB2Q92953 911 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ASB2Q96Q27 587 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 SPRED2Q7Z698 418 aa23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 RPAINQ86UA6 219 aa23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 LPXNO60711 386 aa23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 NAPAP54920 295 aa23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 FAM26DQ5JW98 314 aa23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 STXBP3O00186 592 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 CTSHP09668 335 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP4P98171 946 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GRB10Q13322 594 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 BARHL2Q9NY43 387 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 COL4A6Q14031 1691 aa23.85■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 NID2Q14112 1375 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 LINC01553A4QN01 128 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 AMHP03971 560 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ERVK-21P61565 698 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 SEPT8Q92599 483 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 CDC27P30260 824 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ADCY7P51828 1080 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 PPFIA1Q13136 1202 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 AP3B2Q13367 1082 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 APBB2Q92870 758 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 ANO3Q9BYT9 981 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 INSL6Q9Y581 213 aa23.83■■□□□ 1.41
UBXN4-204ENST00000426921 NFASCO94856 1347 aa23.83■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SIP14410 1827 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 HSPA4P34932 840 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SREBF1P36956 1147 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 KRT40Q6A162 431 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 FBXL16Q8N461 479 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.82■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 GRIK4Q16099 956 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CEP55Q53EZ4 464 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 GLG1Q92896 1179 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 PCYT2Q99447 389 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SMCO2A6NFE2 343 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CHRNA1P02708 482 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MARK3P27448 753 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MGAT3Q09327 533 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 TOP1MTQ969P6 601 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 PGBD1Q96JS3 809 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 KAT6AQ92794 2004 aa23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms