RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 ASTN1O14525 1302 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 ATP9AO75110 1047 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 RGS20O76081 388 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.37■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 IDEP14735 1019 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CCND2P30279 289 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TTI2Q6NXR4 508 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 EYA4O95677 639 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 MUTP22033 750 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 COASYQ13057 564 aa23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PSMA7O14818 248 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 HUNKP57058 714 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 STIM1Q13586 685 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TPH2Q8IWU9 490 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PANK4Q9NVE7 773 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 FBXO40Q9UH90 709 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.35■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 ZBTB39O15060 712 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CNTN2Q02246 1040 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PSMD2Q13200 908 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GIT2Q14161 759 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GPRASP2Q96D09 838 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.34■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CBFA2T2O43439 604 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CCNE1P24864 410 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 PPP1R2P41236 205 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GTF2A2P52657 109 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 Q3C1V9 767 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 P2RX5Q93086 422 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.33■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 CETPP11597 493 aa23.33■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.33■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.33■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 LCTP09848 1927 aa23.33■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 PFASO15067 1338 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 PASKQ96RG2 1323 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 A0A1B0GTH6 734 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 KIF3CO14782 793 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 ERCC3P19447 782 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 OSBPP22059 807 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 FSTL1Q12841 308 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 ARID5BQ14865 1188 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 NR1I3Q14994 352 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 SPRYD7Q5W111 196 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CENPPQ6IPU0 288 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 DNERQ8NFT8 737 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 NEK9Q8TD19 979 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 LXNQ9BS40 222 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.32■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 MAFGO15525 162 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CCNE2O96020 404 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 VSTM4Q8IW00 320 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 BANK1Q8NDB2 785 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 IWS1Q96ST2 819 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 REEP2Q9BRK0 252 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 KCNA2P16389 499 aa23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
GPC1-202ENST00000420138 CCL15Q16663 113 aa23.31■■□□□ 1.32
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