RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 STIM2Q9P246 746 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 NOVP48745 357 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PANK4Q9NVE7 773 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf74Q6P047 294 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 HAS1Q92839 578 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SHTN1A0MZ66 631 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TLR2O60603 784 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PPFIA4O75335 1185 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID5AQ03989 594 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC18Q9H819 358 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 NOL4O94818 638 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A2P36021 539 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP72Q9P209 647 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PMD0 336 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF11O95390 407 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHB4P54760 987 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 VGLL3A8MV65 326 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FTCDO95954 541 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PALMO75781 387 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPING1P05155 500 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SHMT1P34896 483 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D5Q92609 795 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RUBCNQ92622 972 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FOCADQ5VW36 1801 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SNHG28P0DPA3 235 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF543Q08ER8 600 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CUL5Q93034 780 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 EHD4Q9H223 541 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRC1P26715 233 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 EMBQ6PCB8 327 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD1Q719H9 257 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RUFY1Q96T51 708 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ESYT3A0FGR9 886 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 IRAK1P51617 712 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 GABPAQ06546 454 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEB3A0JP26 581 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 POTECB2RU33 542 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L10C9JJH3 530 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL1O95922 423 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 GLI1P08151 1106 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEBQ6S5H4 581 aa20.54■□□□□ 0.88
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