RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 GJD3Q8N144 294 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 BANK1Q8NDB2 785 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 APBB2Q92870 758 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC69A6NI79 296 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 RXRAP19793 462 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PPFIA1Q13136 1202 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 FIBCD1Q8N539 461 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 LY9Q9HBG7 655 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 H3BNC9 293 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SGSM2O43147 1006 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 PRC1O43663 620 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 DDAH1O94760 285 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 IGBP1P78318 339 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 GLG1Q92896 1179 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 IL17RAQ96F46 866 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 NRCAMQ92823 1304 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 MEIS2O14770 477 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 UBE2SQ16763 222 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 RSPH3Q86UC2 560 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 UIMC1Q96RL1 719 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 CLDND1Q9NY35 253 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-202ENST00000415164 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ATP9AO75110 1047 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CHRNA1P02708 482 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GNAQP50148 359 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GRIK4Q16099 956 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 FAM26DQ5JW98 314 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 MAP4K1Q92918 833 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GPRASP2Q96D09 838 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CDHR1Q96JP9 859 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PIK3CDO00329 1044 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GPR37L1O60883 481 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ADAM17P78536 824 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR1Q13613 665 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K14Q99558 947 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 KCNA2P16389 499 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 MCM5P33992 734 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 LPIN1Q14693 890 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CLUL1Q15846 466 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 NEK9Q8TD19 979 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ITGB5P18084 799 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 RPAINQ86UA6 219 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 IGFLR1Q9H665 355 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 TRPC6Q9Y210 931 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 FAM50BQ9Y247 325 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 ENPP3O14638 875 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 GRM6O15303 877 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CALM1P0DP23 149 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CALM2P0DP24 149 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 CALM3P0DP25 149 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCA1P28370 1054 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-202ENST00000415164 MGAT3Q09327 533 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms