RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 CERS5Q8N5B7 392 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RUFY1Q96T51 708 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SERPING1P05155 500 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 IL1R1P14778 569 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 EPS15P42566 896 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ADAM9Q13443 819 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PDIA5Q14554 519 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CUL5Q93034 780 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ZEB2O60315 1214 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 HSF2BPO75031 334 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CYP11B2P19099 503 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CORO7P57737 925 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NFIAQ12857 509 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 DOK7Q18PE1 504 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ARSHQ5FYA8 562 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RSPH10BP0C881 870 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PRLRP16471 622 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 LIG3P49916 1009 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CYP4A11Q02928 519 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GABPAQ06546 454 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 KCNH2Q12809 1159 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SH3GL2Q99962 352 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GAKO14976 1311 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF233A6NK53 670 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RAD51CO43502 376 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TTLL1O95922 423 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SNHG28P0DPA3 235 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NR2F2P24468 414 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SHMT1P34896 483 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PTK2Q05397 1052 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 KCNA1Q09470 495 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TCP10Q12799 353 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ASIC2Q16515 512 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 KCNK3O14649 394 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 MYBP10242 640 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PLCG2P16885 1265 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NOVP48745 357 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GUCY1A3Q02108 690 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PPFIA1Q13136 1202 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NNTQ13423 1086 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NAB2Q15742 525 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SLC18A3Q16572 532 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 USH1GQ495M9 461 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GANQ9H2C0 597 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CENPHQ9H3R5 247 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 USP40Q9NVE5 1235 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 POLD1P28340 1107 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SLC20A2Q08357 652 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PSMD2Q13200 908 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 USP21Q9UK80 565 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ABCB11O95342 1321 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SFI1A8K8P3 1242 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB5O15062 677 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CLIC2O15247 247 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 ATP2B4P23634 1241 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEA9P43362 315 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CASP4P49662 377 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PRR16Q569H4 304 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SFR1Q86XK3 245 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 PROM2Q8N271 834 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-204ENST00000409937 SMARCA1P28370 1054 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms