RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 MEIS3Q99687 375 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 GGA3Q9NZ52 723 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 USP16Q9Y5T5 823 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 GRK4P32298 578 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 MLANAQ16655 118 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN15O95858 294 aa8□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 KIR3DL1P43629 444 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 KSR2Q6VAB6 950 aa8□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 DPF2Q92785 391 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 AK5Q9Y6K8 562 aa8□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 BEND3Q5T5X7 828 aa7.99□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 UTYO14607 1347 aa7.98□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 NUP98P52948 1817 aa7.97□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.97□□□□□ -1.13
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CCL20-202ENST00000409189 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.96□□□□□ -1.13
CCL20-202ENST00000409189 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.96□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 PRRG2O14669 202 aa7.96□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CBX7O95931 251 aa7.96□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.96□□□□□ -1.14
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