RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.78■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 LGR5O75473 907 aa25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 CDHR1Q96JP9 859 aa25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM260Q9NX78 707 aa25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
KDELR3-202ENST00000409006 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 SMCO2A6NFE2 343 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 KIF28PB7ZC32 967 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 TLL1O43897 1013 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 BARHL2Q9NY43 387 aa25.76■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ADAMTS3O15072 1205 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 CTSHP09668 335 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ADCY7P51828 1080 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 RCAN1P53805 252 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ARHGAP4P98171 946 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 FGD1P98174 961 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 IKBKEQ14164 716 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 BRF1Q92994 677 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ANO3Q9BYT9 981 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 REV3LO60673 3130 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.75■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 EMSYQ7Z589 1322 aa25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ARP10275 920 aa25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ARNTL2Q8WYA1 636 aa25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.74■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MAFGO15525 162 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 GJB5O95377 273 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 GNAT1P11488 350 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MARK3P27448 753 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 KRT40Q6A162 431 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 PCYT2Q99447 389 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.73■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 RPS6KB1P23443 525 aa25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 TRANK1O15050 2925 aa25.72■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 NRCAMQ92823 1304 aa25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 PKN1Q16512 942 aa25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.71■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 NID2Q14112 1375 aa25.7■■□□□ 1.71
KDELR3-202ENST00000409006 EFCAB14O75071 495 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 PPFIA3O75145 1194 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 CAND2O75155 1236 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 SCG2P13521 617 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 SREBF1P36956 1147 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 PPFIA1Q13136 1202 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 CEP55Q53EZ4 464 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 FBXL16Q8N461 479 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 GLG1Q92896 1179 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 WDR81Q562E7 1941 aa25.7■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 MEIS1O00470 390 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 LPXNO60711 386 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 REC8O95072 547 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 CHRNA1P02708 482 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 AP3B2Q13367 1082 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 GRIK4Q16099 956 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 FAM26DQ5JW98 314 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 PHKBQ93100 1093 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 RAD9AQ99638 391 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 NFASCO94856 1347 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 GRB10Q13322 594 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 NTRK3Q16288 839 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.68■■□□□ 1.7
KDELR3-202ENST00000409006 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
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