RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 GNPTABQ3T906 1256 aa22.55■■□□□ 1.2
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ODC1-202ENST00000405333 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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ODC1-202ENST00000405333 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.54■■□□□ 1.2
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-202ENST00000405333 C17orf99Q6UX52 265 aa22.53■■□□□ 1.2
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ODC1-202ENST00000405333 CA12O43570 354 aa22.47■■□□□ 1.19
ODC1-202ENST00000405333 ACTR2P61160 394 aa22.47■■□□□ 1.19
ODC1-202ENST00000405333 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ODC1-202ENST00000405333 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.47■■□□□ 1.19
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