RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 MSH4O15457 936 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 LGR5O75473 907 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 ATG7O95352 703 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 CYP2C9P11712 490 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 EPHB4P54760 987 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 CHMP4BP1P59074 171 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 ACTR2P61160 394 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 Q4G0T1 1027 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MESTP1-201ENST00000404287 BTBD18B2RXH4 712 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 RAG1P15918 1043 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 KRT2P35908 639 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 VWCEQ96DN2 955 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SDF4Q9BRK5 362 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.89■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 EMSYQ7Z589 1322 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CYP2C18P33260 490 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SLC5A5Q92911 643 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 GJA10Q969M2 543 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.88■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 WNT7AO00755 349 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SLC37A4O43826 429 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 MCM2P49736 904 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 GUCY1B3Q02153 619 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PTGISQ16647 500 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 MFSD5Q6N075 450 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 C7orf31Q8N865 590 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 WNT8BQ93098 351 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 HIPK3Q9H422 1215 aa21.87■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ADAM17P78536 824 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 NEK8Q86SG6 692 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.86■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PSMD10O75832 226 aa21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 LETM2Q2VYF4 491 aa21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 C8orf76Q96K31 380 aa21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CSF2RAP15509 400 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 RBL2Q08999 1139 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CUL4AQ13619 759 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 RIT2Q99578 217 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 A0A1W2PPC1 479 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 KIF28PB7ZC32 967 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 MARK3P27448 753 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 CCL23P55773 120 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 FPGSQ05932 587 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 TRIM29Q14134 588 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SERINC5Q86VE9 423 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 SETD4Q9NVD3 440 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.83■■□□□ 1.09
MESTP1-201ENST00000404287 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 PITPNM1O00562 1244 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 TREHO43280 583 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 ATP4AP20648 1035 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 KRT76Q01546 638 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 PTK7Q13308 1070 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 GPNMBQ14956 572 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 PLCB4Q15147 1175 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 SHHQ15465 462 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 TDHQ8IZJ6 230 aa21.82■■□□□ 1.08
MESTP1-201ENST00000404287 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms