RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM196BA6NMK8 535 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CETN3O15182 167 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 NOL4O94818 638 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SREBF1P36956 1147 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ARSHQ5FYA8 562 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TSKSQ9UJT2 592 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 DNM3Q9UQ16 869 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RPA1P27694 616 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 STAT3P40763 770 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 PRR16Q569H4 304 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 AKT1S1Q96B36 256 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 NOX5Q96PH1 765 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM9Q13443 819 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MMP10P09238 476 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CIITAP33076 1130 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.45■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEFA5A3E0 1075 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEIP0CG38 1075 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEGQ6S5H5 508 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 VPS18Q9P253 973 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ECE2O60344 883 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ENTPD3O75355 529 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFB10O96000 172 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ERCC3P19447 782 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 GIT2Q14161 759 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 EPS15P42566 896 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 C2orf54Q08AI8 447 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC102AQ96A19 550 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 LENG9Q96B70 501 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 BMP3P12645 472 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAF1Q13077 416 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 STYK1Q6J9G0 422 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 TLR2O60603 784 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF7Q02833 373 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 UIMC1Q96RL1 719 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP3A4P08684 503 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 COG1Q8WTW3 980 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 DRC1Q96MC2 740 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF14Q9UBS8 474 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PAFAH1B1P43034 410 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 GANQ9H2C0 597 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PDXKO00764 312 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 GDF11O95390 407 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 NR2F2P24468 414 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC181Q5TID7 509 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PIK3CDO00329 1044 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 GYS2P54840 703 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNH2Q12809 1159 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 ASIC2Q16515 512 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC18A3Q16572 532 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 USH1GQ495M9 461 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-202ENST00000399409 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms